崇祯委以陈渊以大任，但却没给他文渊阁大学士一职，到底是没让其入阁，这不免让人想入非非。

    皇帝这是不信任陈渊?

    在新政方面，崇祯帝亦并非对陈渊百依百顺，陈渊请求他减免北方灾荒地区的税赋，但崇祯始终犹豫不决，只说等商税收上来后再做打算。

    其实陈渊对于免税并无太大奢求，因为明朝的税赋本就不是很高，按当时的标准，每亩地的额定税平均只有2分5厘白银，约合铜钱二十五板，或是交纳相应数量的粮食。如果按人口负担算，全国2亿人口，人均也不过负税7分白银，加上万历朝“辽响”和本朝拟议中再加的“辽响”共685万两，人均负税也才白银1钱多一点。这样的税率不论是在中国历史上还是同世界各国的情况比较，都是相当低的。

    可惜人民的实际负担情况却远非如此。造成的实际负担加重的主要原因是杂项钱粮太多，所谓的杂项钱粮包括合法的征派，也包括不合法的或是半合法的勒索。明朝正税之外的赋税门类繁多，张居正实行一条鞭法的时候清理过一次，但以后从重蔓延，各类杂税名目新奇，负担沉重，远远超过正税。此外，明代税制又极为僵化，一个行政单位的负税额几乎是百年不变的，如果出现什么影响税负的情况，仍然照旧不变。例如历代亲王们都被朝廷赐予大量土地，像崇祯帝的叔叔福王和瑞王，各自得到的赡养田是2万顷。所谓赐赡养田2万顷，就是每年把2万顷的田租交送给王府，这份租税并没有具体人负责，而是分摊给各省各县，成为当地人民的一项特别负担。但无论哪个地方负担了多少这类额外钱粮，国家的正额赋税一律照旧。这样，有些地方的实际赋税已经10倍于正税了。

    更多的额外负担是非法的或半合法的勒索，列如各种临时的私派及已经成为定例的“耗羡”。所谓“耗羡”是地方政府在正项税差钱粮之外增加的部分，名义上是为了补充转运时所造成的损失，实际则主要用于中饱各级官吏的私囊。私派更是毫无定制，各级官员有的假借军兴而私加，有的假借增响以擅派，有的因工程修筑而巧立名目，有的借解运税粮而加倍征收，或是设立杂项开支，或是借口费用不足，凡设置一个项目，都是增收数十倍。

    有鉴于此，崇祯帝既然不肯在减赋上松口，那陈渊便想在这杂赋杂税上作文章了。

    在陈渊上任户部三日后，陈渊写了一本奏折，递交给了崇祯，言明了税收现状：“各级官员，巧借名目，鱼肉百姓，以朝廷正税之外，另行摊派杂科，百姓不知，以为朝廷皇上所立，不免心生抱怨，朝廷皇上名誉俱损，而贪官中饱私囊，实在可恶!”

    崇祯平生最为爱惜的就是他的名声，现在陈渊告诉他地方官员在搞臭他的名声，他怎能不皇恩震怒，于是下令陈渊，严办此事。

    第二日平台对奏，陈渊就给出了解决措施，其具体如下。

    一是户部新建税务监察司，立待郎统之，分道设官。为避免利益勾结，分道官员选拔新科进士充任。监察司无收税之权，却有监察税务的权力，一旦发现有违规收税的事发生，立即上达户部，转理皇帝，不经内阁之手。

    二是开列税务清单，将本该征的税，该征多少的税都清清楚楚地写在清单上，连耗羡都做了明确规定。监察司官员拿清单下到地方，与地方税务对账，凡清单之内视为合法税务，清单之外即为非法税务，一旦发现，可立即上奏。

    崇祯帝对陈渊的意见十分满意，大手一挥同意了陈渊组建税务监察司。

    就在朝廷大张旗鼓的实行新政之时，大明山东布政使司传来噩耗，原辽东边军孔有德部发生叛乱，攻陷了登州，登莱巡抚孙元化被活捉。

    这起事件，说起来还与当年袁崇焕有关，自崇祯初年，袁崇焕就任辽东都师，毫无征兆的情况下擅自斩杀了皮岛守将毛文龙，致使原属毛文龙部下的一部分官兵惊恐万状，不久就逃离了皮岛各谋生路去了，其中很大一部分浮海逃到胶东，带头的是孔有德、耿仲明和李九成等人。负责胶东半岛防务的登莱巡抚孙元化过去多年任职辽东，对辽东部队比较有感情，就收编了他们，仍由孔有德等人统领。但这支部队却为了主帅被袁崇焕无缘无故的杀死，对明廷深有不满，脑后的反骨并没有脱化。去年十一月，因为辽东大凌河遭受后金围攻，形势吃紧，孙元化奉命调孔有德部队从旱路增援。然登州辽东兵与山东兵素不和，孔有德抵达吴桥时，因遇大雨春雪，部队给养不足，又部队行抵吴桥时，与山东人屡有摩擦，县人皆闭门罢市。有一士兵强取山东望族王象春家仆一鸡，该丁被“穿箭游营”。于是士兵击杀该家仆，事后象春之子不肯罢休，要求查明真相，李九成把孙元化给的市马钱花尽，恐遭非议，便抢劫哗变。

    孔有德受李九成和李应元父子的煽动叛变，带着队伍一路向回杀过来，攻陷了山东的陵县、临邑、商河、青城、新城等地，长驱直入进到胶东，在岁末的时候围困了孙元化驻守的登州城。

    对于这次叛乱，孙元化一直主张和平招抚，朝廷一时没办法调集军队去剿杀，也只得先让孙元化招抚看看。直到叛军兵临城下，孙元化仍然以为自己凭着老关系可以传檄而平乱，还多次写信劝喻孔有德，没有把注意力全放在坚守拒敌上。崇祯五年一月，仍在孙元化军中的耿仲明在城中做内应，登州城破，叛军掳获了旧兵六千人、援兵千人、马三千匹、饷银十万两、红夷大炮二十馀位，西洋炮三百位。总兵张可大斩杀其妾陈氏后，上吊自尽，孙元化自杀未成，不向叛军妥协，城中葡萄牙人有西劳经、鲁未略、拂朗亚兰达、方斯谷、额弘略、恭撒彔、安尼、阿弥额尔、萨琮、安多、兀若望、伯多彔等12人死亡，15人重伤。